摩托车水冷发动机是通过流动的水包裹缸套和缸头来降温。在温度高时节流阀会全部开启水箱开始运作，温度过高时风扇开启降温到发动机的最佳工作温度。

摩托车风冷发动机的工作原理主要是通过空气冷却发动机个部分组件，在车辆行驶时，空气从汽缸头部散热片流入，将汽缸内部的热量带走，再通过尾部的排气管排出。

从散热效果来看，水冷发动机的效果更佳。

外观造型上，风冷发动机的整体结构更简单，且体积更小，重量更轻，适合机动性更强的场景，例如越野拉力和山地骑行。

水冷发动机的体积较大，能容纳更大的气缸和更高效的进排气系统，提升发动机动力，但外观的整体协调度可能不如风冷发动机。

若需要在长途摩旅或高强度骑行状态下，可以选择水冷系统，保证动力的持续输出，和超强的续航能力。

如果预算有限，只是简单的城市通勤代步，结构简单、维护成本低、噪音小的风冷系统，就已经可以满足大部分消费者的需求了。